Knowledge Discovery in Proteomics

I proteomik är det vanligt med flera olika typer av datarepresentationer, brist på kompletta och konsekventa domänteorier, snabb utveckling av domänkunskap, hög dimensionsrikedom samt stora mängder saknad information - dessa är utmaningar som är integrerade i modern proteomik. I takt med att vår förståelse för proteiners struktur och funktion blir allt mer komplicerad har vi nått en punkt där själva hanteringen av data utgör ett betydande hinder för tolkningen av resultat från proteomiska plattformar till kunskapsupptäckt. Boken "Knowledge Discovery in Proteomics" presenterar aktuella och auktoritativa diskussioner om några av de viktigaste frågorna inom högkapacitetsproteomik, utforskar exempel som representerar några av de största utmaningarna inom kunskapsupptäckt på området. Författarna fokuserar på fem specifika områden: Masspektrometri-baserad proteinanalys Analys av protein-protein-interaktionsnätverk Systematisk högkapacitetsproteinutfällning Systematisk integrerad analys av flera databanker Systems biology Inom varje område beskriver författarna de utmaningar som skapas genom den typen av producerade data och presenterar potentiella lösningar på problemet med datagruvning inom domänen. De använder sig av ett systemtänkande tillvägagångssätt, täcker individuell data och integrerar dess beräkningsaspekter, från datapreprocessering, lagring och åtkomst till analys, visualisering och tolkning.